More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1001 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 185 aa  103  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 176 aa  94  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.49 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 219 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  30.08 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  24.84 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  27.33 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  23.65 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  28.89 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  29.9 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  22.93 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.17 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  26.25 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  29.03 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  24.5 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  25.34 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  25.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  25.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  25.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  25.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  25.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  25.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  25.45 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  25.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  25.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  25 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  23.93 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  25 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>