More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0344 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  45.86 
 
 
184 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  46.78 
 
 
180 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 
172 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
168 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  37.86 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
185 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  37.84 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  29.06 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  35.34 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  36.79 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  30.16 
 
 
158 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  33.01 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
154 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 
157 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
163 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
163 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  27.34 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
163 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
157 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  29.03 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  28.36 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  25.21 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
166 aa  52  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  29.01 
 
 
158 aa  52  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
141 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
166 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  30.77 
 
 
161 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 
148 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  33.61 
 
 
261 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  27.1 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  27.1 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  27.1 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  27.1 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
148 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  27.1 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>