More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2359 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  353  8.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 
167 aa  184  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  42.94 
 
 
173 aa  131  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  42.44 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1031  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.89 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
143 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  22.01 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  31.76 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  33.76 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
145 aa  62  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  27.44 
 
 
166 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
146 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
142 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  29.41 
 
 
162 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
172 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  29.94 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  30.32 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  30.57 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
145 aa  58.2  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 
173 aa  57.8  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  29.87 
 
 
178 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
178 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
146 aa  57.4  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  29.03 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 
132 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  31.97 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.82 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  50 
 
 
261 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  30.65 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30.65 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30.65 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30.65 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30.65 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  27.4 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.28 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.56 
 
 
170 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  32.79 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 
140 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  40.79 
 
 
140 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>