More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4212 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
191 aa  383  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
172 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  40.38 
 
 
214 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
167 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  29.73 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
162 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
166 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
136 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
137 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  29.11 
 
 
261 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
148 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 
170 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
148 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
141 aa  58.5  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  30.52 
 
 
175 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
146 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
148 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  28.28 
 
 
163 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
148 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
142 aa  58.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
169 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  28.48 
 
 
160 aa  58.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.78 
 
 
166 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  27.33 
 
 
179 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  26.8 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  34.15 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  34.15 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  34.15 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  34.15 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  34.15 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  34.15 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  34.15 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
147 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 
167 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.3 
 
 
283 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
147 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.88 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.68 
 
 
201 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 
167 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
165 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  27.74 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  32.93 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>