More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1387 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 142 aa  290  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  76.64 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  33.93 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  33.93 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.31 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  31.06 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.37 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.2 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 191 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  34.96 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  34.29 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>