More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4564 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 261 aa  523  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.7 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  32.99 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  31.54 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 169 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 147 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.37 
 
 		 139 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  25.86 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 164 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.37 
 
 		 139 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 163 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 177 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 153 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 157 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 163 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 163 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  36.27 
 
 		 142 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 164 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 156 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 144 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 186 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 157 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 155 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 140 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 159 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 167 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  24.19 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.03 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  24.19 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  24.19 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.24 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  34.33 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.89 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  24.19 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  24.19 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  20.57 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>