More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00668 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  31.9 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  31.9 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  31.9 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  31.9 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  30.67 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.06 
 
 		 173 aa  84.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  28.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  28.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  28.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  28.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  28.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  28.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  28.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  29.09 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  28.48 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  28.48 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  29.09 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  31.25 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  34.19 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  27.65 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  28.4 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  27.81 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.75 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  28.85 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  28.1 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  29.79 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  31.86 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  30.72 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  32.5 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.17 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.62 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>