More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3139 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  85.19 
 
 		 162 aa  282  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  85.19 
 
 		 162 aa  282  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  41.61 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  39.85 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  40.77 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 171 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 193 aa  84.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  35.66 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  37.21 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.78 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.78 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.78 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.78 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.78 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.78 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.61 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  34.78 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  34.78 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  23.88 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.37 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.37 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.37 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.37 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.37 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>