More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1295 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 147 aa  296  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  85.03 
 
 		 172 aa  253  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  82.31 
 
 		 149 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 193 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 172 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 195 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  39.85 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  43.75 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 177 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  38.06 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 180 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  39.53 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  37.31 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  37.21 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 178 aa  89.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  32.82 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.3 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.3 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>