More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2025 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 
158 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  58.21 
 
 
147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 
172 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
149 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 
171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
165 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
164 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
165 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
165 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  38.78 
 
 
177 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
165 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
165 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
165 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
163 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  39.87 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
178 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
180 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 
145 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
180 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
150 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 
171 aa  99  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
171 aa  98.6  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
164 aa  97.8  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.89 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  32.65 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.57 
 
 
162 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
145 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
156 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
156 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.08 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
138 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
140 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
142 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
157 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  30.67 
 
 
157 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
141 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  31.01 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 
151 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 
142 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>