More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1443 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  79.76 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  62.89 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 178 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  41.72 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  41.67 
 
 		 147 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  39.72 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 193 aa  94  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 145 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.06 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  36.81 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  37.88 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.17 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.92 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  32.43 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>