More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1859 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  77.18 
 
 		 152 aa  240  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  48.3 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 180 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 159 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  31.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  31.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  31.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  31.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 190 aa  73.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.28 
 
 		 191 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.46 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.46 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>