More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1577 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  59.01 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  51.15 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  37.68 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  35.38 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  34.85 
 
 		 135 aa  87.4  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  34.62 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  35.04 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  32.64 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  35.59 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  34.09 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  34.75 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  31.82 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  34.38 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  39.36 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  32.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.04 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.91 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.02 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  36.94 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>