More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1027 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  52.74 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  47.77 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  47.4 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  50 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  48.34 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 157 aa  148  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  51.41 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  44.81 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  46.79 
 
 		 158 aa  141  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  50.37 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  45.27 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  43.23 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 148 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  41.72 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  37.41 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  97.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 170 aa  97.4  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  90.5  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  38.46 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.08 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  27.41 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  35.87 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  33.65 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>