More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0611 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  100 
 
 		 135 aa  273  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  81.2 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  62.96 
 
 		 158 aa  167  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  63.24 
 
 		 167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 174 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  45.19 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 165 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 165 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  45.19 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  45.93 
 
 		 162 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  40 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  40.74 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  41.18 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 182 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  33.83 
 
 		 187 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  30.3 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.94 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  25.58 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.13 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  31.18 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.61 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>