More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1979 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  292  9e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  81.12 
 
 
148 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  81.12 
 
 
148 aa  238  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 
171 aa  121  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
150 aa  120  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.58 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.58 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
150 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
150 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  40.6 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
159 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  45.13 
 
 
148 aa  110  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
151 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 
155 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  36.92 
 
 
195 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  39.37 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
151 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
154 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  35.11 
 
 
154 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 
157 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  36.09 
 
 
158 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
178 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
153 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
156 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
156 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 
149 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
149 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
149 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.69 
 
 
162 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 
146 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
144 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
185 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
146 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
162 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
155 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  33.58 
 
 
167 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
145 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
153 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
170 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
151 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
141 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
147 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  35.25 
 
 
153 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  34.96 
 
 
146 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
163 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  34.96 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 
169 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  34.96 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  35.48 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.66 
 
 
152 aa  95.9  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 
153 aa  95.9  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  37.82 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
163 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  39.02 
 
 
163 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 
166 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
158 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  34.96 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
168 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.68 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
147 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
147 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
148 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>