More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2470 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  40.29 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  40.29 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  39.01 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  35.46 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  98.6  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  37.59 
 
 		 191 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  36.3 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  36.3 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  33.33 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  32.84 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  32.86 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  37.82 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.01 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  35.88 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  28.76 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  33.87 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.21 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  32.14 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  32.14 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  37.89 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.61 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>