More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3289 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  78.01 
 
 
153 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  60.69 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 
149 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
144 aa  133  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
141 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  56.39 
 
 
139 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  49.62 
 
 
144 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  50.36 
 
 
156 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  51.82 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 
143 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 
143 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 
143 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 
151 aa  113  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  50.78 
 
 
161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 
163 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  43.28 
 
 
146 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 
152 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 
158 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 
143 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  40.91 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  37.59 
 
 
163 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
157 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
175 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.59 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  37.39 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  34.11 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.09 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
296 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
167 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>