272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1713 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  317  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 
149 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 
151 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 
151 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 
151 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  56.93 
 
 
151 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
147 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
145 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
156 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  38.52 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.65 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  35.34 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  35.45 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  32.58 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  34.82 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  32.71 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  32.77 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
127 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
165 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  38.54 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  39.73 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
149 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
184 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  29.73 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.58 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  30.07 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.58 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>