242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7164 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  292  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.59 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  31.88 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  31.93 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  29.66 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 161 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2286  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.71 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>