More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4006 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  44.53 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  43.26 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  44.96 
 
 		 158 aa  98.6  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  46.92 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 159 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  40.29 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  44.96 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  43.94 
 
 		 156 aa  93.6  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  42.2 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  45.95 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  43.24 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 163 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.01 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>