166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3208 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 
162 aa  321  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  98.77 
 
 
162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  90.32 
 
 
156 aa  277  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  88.39 
 
 
156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  85.92 
 
 
159 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  55.03 
 
 
150 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 
150 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  54.93 
 
 
150 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  57.43 
 
 
150 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  60.45 
 
 
150 aa  148  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  50.89 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
147 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
151 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
147 aa  97.1  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
151 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
162 aa  90.9  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
150 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  43.48 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  36.84 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  37.76 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  36.5 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  42.72 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  36.5 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
171 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
171 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.46 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.61 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  37.37 
 
 
171 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
163 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
150 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.04 
 
 
138 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
127 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 
139 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  35 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  31.65 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>