More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4830 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  309  7.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  82.35 
 
 
151 aa  226  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  77.37 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  78.1 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  77.24 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  42.34 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  36.94 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  31.62 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.52 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.55 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
162 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.33 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  32.82 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  53.9  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  36.19 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
143 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
150 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
143 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.97 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  37.36 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>