More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1242 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  251  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  249  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  98.45 
 
 		 150 aa  247  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  77.24 
 
 		 157 aa  193  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  40.83 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.28 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.9 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.25 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.87 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  29.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.67 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.67 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.67 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.67 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.67 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  29.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.67 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  36.46 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  39.51 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.52 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>