More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0722 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  359  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  80.61 
 
 		 175 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  79.39 
 
 		 173 aa  278  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  80.82 
 
 		 168 aa  253  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  73.94 
 
 		 170 aa  251  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  77.27 
 
 		 169 aa  250  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  45.19 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  32.26 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  31.82 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.82 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  31.82 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.82 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  27.82 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  24.68 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  30.1 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.31 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  31.48 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.17 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.73 
 
 		 201 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  24.34 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2853  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1191  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2630  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>