More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2765 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  328  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  71.85 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  71.11 
 
 		 170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  60 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  39.83 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  47.13 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  45.98 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  34.85 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  43.62 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  33.81 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  42.03 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  27.73 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  39.34 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  39.34 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 296 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  31.93 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.24 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  32.61 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.56 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  27.39 
 
 		 192 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>