More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3567 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  293  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  87.23 
 
 		 150 aa  255  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  43.75 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  50.75 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  46.25 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  30.33 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  39.73 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  24.46 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  25.98 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  29.57 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 195 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 296 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  31.53 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  28.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  31.53 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  27.97 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 154 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  27.12 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  27.97 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  29.93 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  27.97 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  27.12 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>