More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4527 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  299  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  80.56 
 
 		 144 aa  233  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  75.18 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  75.52 
 
 		 144 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  70.71 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  70.71 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  40.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  45 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.72 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.72 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  26.62 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  38.83 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.03 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  31.15 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  33.02 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.14 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  23.77 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  30.83 
 
 		 287 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.1 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  30.17 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.97 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>