More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3793 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  57.64 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  57.64 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.93 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  33.07 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  39.06 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  38.32 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.91 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.91 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.15 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  36.19 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  30.28 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.62 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  25.17 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  36.19 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  36.19 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.59 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  26.47 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>