More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2688 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 206 aa  73.9  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.28 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 292 aa  67  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  26.76 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  25.35 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  28.48 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  23.29 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  23.29 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  27.59 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  22.6 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  23.29 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  27.84 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1533  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 93 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  26.79 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  22.86 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>