More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1297 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  100 
 
 
174 aa  349  8.999999999999999e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  38.19 
 
 
292 aa  86.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  30.26 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  33.08 
 
 
206 aa  67.4  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  28.47 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
150 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  31.03 
 
 
157 aa  60.8  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 
233 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  33.03 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
147 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
145 aa  58.2  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 
138 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
166 aa  57.8  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  30.56 
 
 
166 aa  57.4  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
143 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
146 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
174 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  33.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  29.9 
 
 
261 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>