213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2084 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  303  9.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
162 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
153 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  45.97 
 
 
277 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 
149 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  41.8 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
145 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  40.65 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
137 aa  90.5  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
141 aa  87.8  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
141 aa  87.8  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
141 aa  87.8  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
141 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 
135 aa  84.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  40.31 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
138 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
208 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.45 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
180 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.31 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
167 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  32.08 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.66 
 
 
156 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  39.24 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>