251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5869 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  97.2 
 
 
143 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  97.2 
 
 
143 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  96.5 
 
 
143 aa  276  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  91.61 
 
 
143 aa  267  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  91.61 
 
 
143 aa  267  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  58.27 
 
 
144 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  58.27 
 
 
144 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
142 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
152 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.43 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  24.27 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  29.21 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
165 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 
179 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  42.55 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  25 
 
 
292 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  37.14 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.48 
 
 
159 aa  48.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  26.92 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
141 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
142 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
143 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
147 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
162 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
168 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
162 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
164 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
148 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.99 
 
 
154 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  25.6 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.21 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>