More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1458 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  100 
 
 		 149 aa  292  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  59.06 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  43.93 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.07 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  37.84 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  34.82 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  27.59 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>