More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1975 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  316  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  57.79 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
142 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.25 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  40.91 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  30.47 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  42.35 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  36.43 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  34.35 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  44.16 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.64 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.64 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  26.4 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  33.04 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.79 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  39.29 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>