More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1670 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  287  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  287  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  96.5 
 
 
143 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  91.97 
 
 
154 aa  258  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  91.3 
 
 
138 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  91.3 
 
 
138 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  91.3 
 
 
138 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  91.3 
 
 
138 aa  255  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  89.86 
 
 
157 aa  253  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  84.44 
 
 
138 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  83.33 
 
 
138 aa  233  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  81.16 
 
 
139 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  79.14 
 
 
147 aa  227  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  74.64 
 
 
139 aa  216  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  80.15 
 
 
137 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  75.74 
 
 
138 aa  205  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.59 
 
 
142 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
193 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
158 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
191 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
195 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  29.46 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
175 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  32.59 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 
192 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>