297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4622 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  357  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 176 aa  224  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  55.09 
 
 		 192 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  55.09 
 
 		 192 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 198 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4788  MarR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 124 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.421103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 141 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.62 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.46 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  29.2 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.53 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  28.79 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  31.16 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.52 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  26.52 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  25.97 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  24.83 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  25.38 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  24.26 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>