More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1858 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
168 aa  343  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
193 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
176 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 
192 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 
192 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
198 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
181 aa  94.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 
140 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  33.61 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4788  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.421103  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.01 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  35.64 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  35.64 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
195 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
139 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
145 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
149 aa  60.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  28.06 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.17 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
198 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.19 
 
 
292 aa  58.2  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  28.68 
 
 
139 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
157 aa  57.8  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
143 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
143 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
166 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>