More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0111 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
139 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
139 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
140 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  33.88 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  37.17 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  33.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  33.88 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  33.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  33.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  33.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  33.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  33.88 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  34.51 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  34.51 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  34.51 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  34.51 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  34.51 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.88 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
162 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  29.93 
 
 
185 aa  62  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
162 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  31.09 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  34.78 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  34.51 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  26.95 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  34.51 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  32.74 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.74 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>