More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2240 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  95.65 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  95.65 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  95.65 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  95.65 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  87.33 
 
 		 154 aa  265  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  90.58 
 
 		 143 aa  253  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  89.86 
 
 		 143 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  89.86 
 
 		 143 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  80.85 
 
 		 147 aa  235  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 138 aa  234  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  82.96 
 
 		 138 aa  230  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  78.99 
 
 		 139 aa  223  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  73.91 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  76.64 
 
 		 138 aa  207  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  77.21 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.58 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.04 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  28.46 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  34.88 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  29.13 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  30.28 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>