More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1286 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  68.28 
 
 		 146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.82 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  32.06 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 150 aa  57  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  29.85 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.55 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  36.47 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  37 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 164 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 195 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>