More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3073 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  348  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 303 aa  60.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  26.56 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  27.7 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.69 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  29.77 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.77 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  29.77 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  25 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.77 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.77 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.77 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.77 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.77 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>