More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2258 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  308  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  90.26 
 
 
155 aa  273  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  89.61 
 
 
155 aa  273  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
169 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
147 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
159 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
156 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  43.26 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
154 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
146 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
146 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
146 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
146 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
160 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.99 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  32.58 
 
 
324 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  34.07 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  35.25 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  25.74 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.97 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.45 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  30.53 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.54 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.36 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.36 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>