More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0861 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  314  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  39.87 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  41.73 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 178 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 178 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  43.09 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 162 aa  94  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  40.68 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  45.8 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 180 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  43.09 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 195 aa  90.5  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  40.68 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  40.34 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  36.24 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  39.5 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.25 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  34.04 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  34.43 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  35.83 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  34.17 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  34.17 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  30.07 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  35 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  35.83 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>