More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0022 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  326  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  326  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  326  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  326  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  326  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  99.39 
 
 		 177 aa  324  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  99.39 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  92.31 
 
 		 181 aa  284  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  78.62 
 
 		 163 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  78.88 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  78.88 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  76.4 
 
 		 162 aa  244  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  76.88 
 
 		 162 aa  244  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  76.88 
 
 		 162 aa  244  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  76.43 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  65.19 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  45.32 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  48.23 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  43.17 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  43.92 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  43.92 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  42.57 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  42.34 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  38.51 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  42.36 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 171 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 172 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  41.3 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  36.55 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 178 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 178 aa  87.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.38 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.38 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.38 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.38 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.38 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.38 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  35.38 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  35.38 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.67 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.85 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>