More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  314  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  96.79 
 
 
156 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 
157 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  53.69 
 
 
157 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  53.69 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  53.69 
 
 
157 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  52.05 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  50.68 
 
 
162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
162 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
163 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
172 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
149 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
180 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  36.62 
 
 
177 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  36.15 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.97 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  43.85 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  43.85 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  43.85 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  43.85 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  43.85 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  43.85 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  43.08 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  43.08 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
172 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 
177 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
145 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.76 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.43 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
163 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
163 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  33.56 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
171 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  40.77 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  37.27 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.36 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>