More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1601 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  291  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  74.13 
 
 		 177 aa  222  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  68.79 
 
 		 150 aa  206  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  67.83 
 
 		 145 aa  199  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  64.34 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 145 aa  189  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  45 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 163 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 		 180 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 180 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 181 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  38.36 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  39.04 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 172 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  39.68 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 178 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  35.88 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 171 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 178 aa  88.6  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 171 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 178 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.13 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.13 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.13 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.13 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.13 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.13 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  34.13 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  34.13 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.54 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.81 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.81 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.81 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.81 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.81 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>