More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3745 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  361  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  49.36 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 163 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  38.24 
 
 		 147 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  36.24 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.46 
 
 		 150 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 172 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 145 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35.56 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  34.25 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  36.75 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  39.62 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.09 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  29.75 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  26.56 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.13 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  29.31 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>