More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2224 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  99.36 
 
 		 157 aa  316  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  98.73 
 
 		 157 aa  313  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  91.72 
 
 		 157 aa  296  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  66.88 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  59.35 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  60 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  53.69 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  40.29 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  39.16 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 172 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 171 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  37.32 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 180 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 171 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 180 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  37.06 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  37.86 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.69 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  38.46 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.46 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3237  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0016294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  40.95 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>