More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1979 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  286  9e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0265  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1998  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1623  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  22.43 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  24.76 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  25.96 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  26.58 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  25.3 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  24.04 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.32 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 309 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  28.38 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  23.89 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 340 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 340 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  21.67 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  23.58 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>